Die museumkompleks is 'n gerekonstrueerde kragstasie uit die vroeë 20ste eeu, 'n baksteenstruktuur met neoklassieke pleisterwerkversiering, waarin die kristalvormige vorms van Libeskind ingebed is. Van buite lees hulle soos kubieke en langwerpige blou vlekvrye staalvolumes wat uit die gebou se vloere uitsteek. Hulle is in die vorm van twee letters van die Hebreeuse alfabet - "hoed" en "jod", wat saam die leuse vorm van Libeskind se projek L'Chaim, wat "tot die lewe" beteken. Dit is egter slegs leesbaar as u na die gebou van bo kyk, wat ontoeganklik is vir die gemiddelde besoeker van die museum.
In die voorportaal van die museum is die muur oorkant die ingang gevoer met gemerkte reliëflyne wat die woord 'pardes' vorm, wat 'tuin van Eden' beteken, en ook die vier vlakke van begrip van die Torah simboliseer. Maar hierdie element van die projek word ook moeilik ervaar as gevolg van die skerp draaie in die voorportaal.
Op die hoofweg - die eerste vlak van die kompleks - is daar ook 'n ouditorium (op die plafon waarvan 'n kaart van die Heilige Land abstrak afgebeeld word), 'n opvoedkundige sentrum en galerye. Op die tweede verdieping is daar administratiewe persele, sowel as 'n gelyknamige uitstallingsaal in 'n groot kubus met die letter "jodium", wat deur 36 veelhoekige vensters verlig word.
Libeskind beklemtoon self die verskil tussen die gebou in San Francisco en sy Joodse museums in die Ou Wêreld: die Kaliforniese gebou het nie die stempel van die Holocaust-katastrofe nie, wat noodwendig in sy Europese projekte voorkom. Desondanks het die taal van die argitektuur van Libeskind dieselfde gebly: die skerp, gebreekte lyne wat voorheen die historiese tragedie gesimboliseer het, moet nou die 'hutte van die hemel' verteenwoordig van 'n vooruitstrewende Joodse diaspora aan die Stille Oseaan-kus.
